Невидимые темы удалял путем повторной их установки в память телефона, после чего они появлялись в диспетчере. Один раз остался хвост от jawa-игры NFS, удалил через комп: в поиске забил название игры, узнал дату и время ее установки, затем забил поиск всех файлов по этой дате и времени - все найденые файлы удалил из смарта. Хвост от NFS исчез.