Статья сама по себе ошибочна (может и не доконца, но всё же), она, применительна только к жёстким дискам. Автор, прости уж!
Размер кластера на твердотельных накопителях (флэш, ссди диски) влияет на скорость, но... это из-за размера блоков, которые использует контроллер. Нужно копать в сторону выравнивания кластеров. Что то типа: "Форматирование флешевых накопителей с выравниванием кластера на границу блока"
-------------
Добавлено в 22.39: Маленькое уточнение, при одном и том же размере кластера, но с разными первоначальными смещениями могут быть сильные различия скорости чтения/записи.