apissz, выключите в программе кеширование и удалите папки с недокаченными файлами, даже если они весят 0 кбайт. Вы считали все папки, с системными?
Можно еще удалить торрент из самой программы (сам торрент файл вроде должен остаться, на всякий случай скопируйте его куда нибудь)
-------------
добавлено в 02.14: Кстати классная прога.
Единственный минус (хотя может это у меня так, если кто знает как это решить буду рад 
), когда выбираешь в списке торрент файла один файл, то качаются еще и два соседних (один сверху и один снизу). Это очень плохо, особенно когда файлы много весят, а скачать нужно только один выбранный.
И кстати upload работает Я один раз когда качал музыку и закачка закончилась то началась выгрузка (и в программе и в диспетчере соединений была видна скорость исходящего трафика) и было написано sharing. Но потом я вышел, а так не знаю сколько бы это длилось.